细菌总数可作为评价水质清洁程度和净化、消毒效果的指标。细菌总数增多说明水被污染，但不能说明污染来源，必须结合总大肠菌群来判断水质污染的来源和安全程度。
据凋查，国内水厂的出厂细菌总数均在每毫升100个以下，有相当一部分在10个以下。故标准限值为每毫升不超过100个。
