进入水体的天然有机化合物，如糖类、纤维素、脂肪、蛋白质等，一般较易通过生物降解。有机物降解的共同规律是：首先，在细胞体外发生水解，然后在细胞内部继续水解和氧化。降解的后期产物都是生成各种有机酸。在有氧条件下，这些有机酸可以进行彻底氧化，其最终产物是CO₂，H₂O及NO₃^-等；在缺氧条件下，进行反硝化，酸性发酵过程，其最终产物除CO₂和H₂O外，还有NH₃、有机酸、醇等。这就是有机污染物在水体中进行生物降解时的基本情况。